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利用阿里達摩院AI算法,首次將新冠病毒疑似病例基因分析縮短至半小時!

來源:廠商投稿

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所屬頻道:新聞中心

關鍵詞:阿里云 AI 疫情 自動化

    2月1日,浙江省疾控中心上線自動化的全基因組檢測分析平臺。利用阿里達摩院研發的AI算法,可將原來數小時的疑似病例基因分析縮短至半小時。


    疫情發生后,達摩院算法專家顧斐博士立即奔赴浙江省疾控中心,第一時間針對新型冠狀病毒基因進行特征分析,并推出多個算法模型。在序列比對過程中,達摩院對算法增加了分布式設計,有效提升比對。

    阿里巴巴相關負責人2月1日表示,“可以這么理解,全基因序列的分析比對會產生大量數據,并需要大量計算,縮短時間的本質就是優化算法提高計算效率和分析能力。”這種分布式的設計和區塊鏈技術并不相同,而是類似于云計算。

    當前,全國新型冠狀病毒肺炎疫情依然嚴峻,快速、精確診斷對于疫情控制尤其重要。公開信息顯示,該病毒是基因組序列最長的病毒之一,全基因組序列全長29847bp,臨床診斷需要將患者樣本與該病毒基因序列進行比對才能確定診斷結果。

    目前醫院普遍采用核酸檢測方法,其只能檢測到病毒基因的局部。由于病毒存在變異的可能性,對于整個基因序列來說這種檢測方法猶如盲人摸象,一旦病毒發生變異,就可能出現漏檢。

    浙江的全基因組檢測分析平臺由浙江省疾病預防控制中心、阿里達摩院醫療AI團隊和杰毅生物技術公司共同研發。該平臺采用不同于核酸檢測方法的全基因組檢測技術,對疑似病例的病毒樣本進行全基因組序列分析比對,能夠有效防止病毒變異產生的漏檢,并將原需數小時的全基因分析流程減少到半小時,大幅提高疑似病例的確診速度和準確率。


    浙江省疾控中心基因測序負責人孫逸博士表示:“該平臺基于阿里云的強大算力與達摩院新算法可以為病毒的解析提供支撐,基于該平臺,未來還可以在短時間內將檢測范圍覆蓋整個確診病例,也為后續疫苗與藥物研發打下了堅實基礎。”

    阿里巴巴相關人士對記者透露,后續達摩院還將參與疫苗技術的研發,同樣也是醫療ai的算法分析和算力支持。

    我們成功從死神手里搶回了寶貴的時間!要知道,新型冠狀病毒是有史以來基因組序列最長的病毒之一,全長29847bp,更可怕的是它隨時可能發生變異!傳統局部檢測早已不大適用,此次浙江采用的全基因組檢測技術,能有效防止病毒變異產生的漏檢。達摩院科學家更針對性研發多個AI算法比對模型,大大提升了檢測效率,為后續疫苗與藥物研發打下堅實基礎!


    (審核編輯: KEEP)

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