氣相色譜儀氣路系統，是一個載氣連續運行、管路密閉的系統。氣路系統的氣密性，載氣流速的穩定性，以及流量測量的準確性都對色譜實驗結果有影響，需要注意控制。常用的載氣有：氫氣、氮氣、氦氣、氬氣和空氣。