功能模塊的基本操作，包括模塊的移動、復制、刪除、轉向、改變大小、模塊命名、顏色設定、參數設定、屬性設定、模塊輸入輸出信號等。
　　模塊庫中的模塊可以直接用鼠標進行拖曳（選中模塊，按住鼠標左鍵不放）而放到模型窗口中進行處理。
　　在模型窗口中，選中模塊，則其4個角會出現黑色標記。此時可以對模塊進行以下的基本操作。
　　移動：選中模塊，按住鼠標左鍵將其拖曳到所需的位置即可。若要脫離線而移動，可按住shift鍵，再進行拖曳。
　　復制：選中模塊，然后按住鼠標右鍵進行拖曳即可復制同樣的一個功能模塊。
　　刪除：選中模塊，按Delete鍵即可。若要刪除多個模塊，可以同時按住Shift鍵，再用鼠標選中多個模塊，按Delete鍵即可。也可以用鼠標選取某區域，再按Delete鍵就可以把該區域中的所有模塊和線等全部刪除。
　　轉向：為了能夠順序連接功能模塊的輸入和輸出端，功能模塊有時需要轉向。在菜單Format中選擇Flip Block旋轉180度，選擇Rotate Block順時針旋轉90度。或者直接按Ctrl+F鍵執行Flip Block，按Ctrl+R鍵執行Rotate Block。
　　改變大小：選中模塊，對模塊出現的4個黑色標記進行拖曳即可。
　　模塊命名：先用鼠標在需要更改的名稱上單擊一下，然后直接更改即可。名稱在功能模塊上的位置也可以變換180度，可以用Format菜單中的Flip Name來實現，也可以直接通過鼠標進行拖曳。Hide Name可以隱藏模塊名稱。
　　顏色設定： Format菜單中的Foreground Color可以改變模塊的前景顏色，Background Color可以改變模塊的背景顏色；而模型窗口的顏色可以通過Screen Color來改變。
　　參數設定：用鼠標雙擊模塊，就可以進入模塊的參數設定窗口，從而對模塊進行參數設定。參數設定窗口包含了該模塊的基本功能幫助，為獲得更詳盡的幫助，可以點擊其上的help按鈕。通過對模塊的參數設定，就可以獲得需要的功能模塊。
　　屬性設定：選中模塊，打開Edit菜單的Block Properties可以對模塊進行屬性設定。包括Description屬性、 Priority優先級屬性、Tag屬性、Open function屬性、Attributes format string屬性。其中Open function屬性是　　一個很有用的屬性，通過它指定一個函數名，則當該模塊被雙擊之后，Simulink就會調用該函數執行，這種函數在MATLAB中稱為回調函數。
　　模塊的輸入輸出信號：模塊處理的信號包括標量信號和向量信號；標量信號是一種單一信號，而向量信號為一種復合信號，是多個信號的集合，它對應著系統中幾條連線的合成。缺省情況下，大多數模塊的輸出都為標量信號，對于輸入信號，模塊都具有一種“智能”的識別功能，能自動進行匹配。某些模塊通過對參數的設定，可以使模塊輸出向量信號。